Co umí?
- Ovládání motorizovaných mikroskopů a příslušenství.
- Automatické nastavení kamery (i průběžné), indikace kvality obrazu.
- Rozličné možnosti zobrazení včetně reálných barev.
- Automatické úpravy obrazů, například zvýraznění kontrastu a barvení.
- Vkládání anotací včetně uživatelsky definovaných frází.
- Intuitivní, přehledná, flexibilní a bezpečná správa dat s pomocí výkoné SQL databáze.
- Rychlá tvorba zpráv včetně zpráv souhrných. Možnost uložení v databázi, tisku nebo výstupu ve formátu PDF.
Snímání obrazů
Snímání obrazů je pro fluorescenční experimenty zásadním krokem ovlivňujícím do velké míry kvalitu výsledků. Kamery dodávané s balíkem LUCIA Cytogenetics proto splňují vysoké požadavky na citlivost a bezproblémovou funkčnost při snímání vzorků s nízkou intenzitou světla.
Nastavení kamery při snímání vícekanálových obrazů se ukládá pro každý kanál (fluorescenční sondu) samostatně.
Aby se práce se snímáním různých fluorescenčních vzorků zjednodušila, umožňuje LUCIA definovat fluorescenční sondy a jejich vlastnosti. Z definovaných sond je se poté skládají sady pro jednotlivé typy vzorků např. HER2. LUCIA obsahuje základní sadu sond nejčastěji používaných v cytogenetice.
Během snímání se nastavení kamery může automaticky přizpůsobovat intenzitě vzorku v rozném poli. Pokud vzorky obsahují nečistoty, lze uživatelem určit oblast zájmu na které bude kamera optimalizovat kvalitu obrazu.
Pro usnadnění hledání buněk a zaostření je živý náhled zobrazován s kratší expoziční dobou na úkor kvality (obraz více šumí). Poměr rychlosti a kvality lze snadno nastavit.
Systémy LUCIA nabízí připojení moderních fluorescenčních motorizovaných mikroskopů i přídavných zařízení (externí filtry, skenovací stolky aj.).
Zpracování obrazu
Pro zvýšení kvality výsledku analýzy nebo při přípravě prezentačních materiálů je často potřeba obrazy dále zpracovat. LUCIA nabízí pro tyto účely mnoho možností: úpravy barev, změnu kontrastu a světlosti, posuvy barev, odtranění barevných přeslechů aj. Většinu úprav lze aplikovat selektivně na jednotlivé kanály, na celý obraz nebo pouze na vybranou oblast v obraze.
Dále je možné vložit anotace. Ty se ukládají do samostatné vektorové vrstvy a nejsou částí obrazových dat. Proto můžete anotace kdykoliv snadno přesunout nebo změnit. Pro snadné vkládání textových anotací lze definovat často používané fráze a ty potom vkládat jedním pohybem myši.
Databáze
Nasnímané a analyzované obrazy se v ideálním případě ukládají do databáze společně s daty vyšetřovaných pacientů. Systém pracuje s výkonnou databází standardu SQL. Data se ukládají na jedno místo - na server. Tím se mnoho věcí zjednodušší - údržba a zálohy jsou jednoduché, uživatel může pracovat na různých pracovištích nebo i doma a připojovat se k databázi přes internet. Komunikaci s databázovým serverem lze zabezpečit (šifrovat). Další výhodou databázového serveru je možnost uložení velmi velkého množství dat, které lze prohledávat, prohlížet a analyzovat mnohem rychleji než na samostatném PC. Databáze poskytuje další funkce a možnosti práce s pacientskými daty (kontrola duplicity, souhrnné statistiky, předvyplnění formulářů, atp.) dále umožňuje ukládání zpráv, informací o preparátech nebo uživatelských nastavení.
Zprávy
LUCIA umožňuje tvorbu zpráv, které obsahují obrázky a data o pacientovi či vyšetření. Zprávu můžete vytvořit ručně, podobně jako když vytváříte dokument v textovém editoru, nebo lze využít funkce šablon. Tu pak využijete zejména při opakovaných úlohách, kdy se do šablony pouze "nasypou" informace o právě provedené úloze. Nejvýkonnější a časově nejúspornější je vytváření zpráv z dat uložených v databázi. LUCIA může uložit zprávu nebo šablonu zprávy do samostatného souboru, ale také do databáze, kde mohou být sdíleny s odtatními uživately. Do zpráv lze také vkládat data ve formě čárových kódů a zefektivnit tak pracovní postupy.